巩膜炎或称深层巩膜炎，较表层巩膜炎少见，但发病急，且常伴发角膜炎及葡萄膜炎，故较表层巩膜炎更为严重，预后不佳，一般表层巩膜炎极少侵犯巩膜组织，巩膜炎则侵犯巩膜本身，巩膜炎多好发于血管穿过巩膜的前部巩膜，而伴于赤道后部的巩膜炎，因不能直接见到及血管少，发病亦少，容易被忽略，巩膜炎依部位可分为前巩膜炎及后巩膜炎，前巩膜炎是巩膜炎中常见的，多发于青年或成年人，女性多于男性，双眼可先后或同时发病。

　　巩膜炎主为内源性抗原抗体免疫复合物所引起，且多伴有全身胶原病，与自身免疫有关，将免疫原性归结为：炎症直接侵犯胶原本身或巩膜基质（氨基葡聚糖），原发性坏死性前巩膜炎病人对巩膜特异性抗原的耐受性可能有改变，并对巩膜可溶性抗原呈迟发型超敏反应，在类风湿关节炎中发现免疫复合物就是对这种理论的支持，但多数巩膜炎却难查到原因。