后天性麻痹性斜视首先应针对发病原因采取保守治疗，在保守治疗无效、且病情稳定达6个月以上者可考虑手术治疗。而先天性麻痹性斜视则多以早期手术矫正为主。
1）病因治疗：
常见的病因有颅内占位性病变、颅脑炎症、颅脑外伤、鼻窦炎症及糖尿病等，应会同有关科室检查、治疗。
2）药物治疗：
对原因不明或考虑系炎症引起者可用抗菌素与激素联合治疗。
3）支持疗法：
可肌注维生素B1、维生素B12、肌苷、ATP以及针灸、理疗等促进麻痹肌功能的恢复。
4）消除复视：
遮盖一眼可消除复视引起的各种不适，为了促进麻痹肌功能的恢复及避免直接对抗肌发生痉挛及挛缩，目前多主张遮盖健眼。
5）三棱镜矫正：
对小于10?斜视引起的复视可用三棱镜治疗；大于10?者可选用压贴三棱镜平均分置双眼。
6）手术治疗原则：
①为了适应生活与工作需要，手术设计应首先考虑正前方与下方的功能，所以要尽可能将高眼位降下来。
②手术一般应在非注视眼进行，例如用键眼注视的上直肌麻痹，可减弱麻痹肌的直接对抗肌（该眼的下直肌）；若患者用麻痹眼注视，则减弱其配偶肌（健眼的下斜肌）。
③麻痹性斜视手术设计应以减弱直接对抗肌或其配偶肌的功能为主，因加强性手术的效果远不如减弱性手术明显。
④对于垂直麻痹性斜视，手术时应尽量避免过矫，否则会产生不适。
⑤为了避免眼球前部缺血及不良后果的发生，手术时，每次一眼不应超过两条直肌。
