角膜移植的手术一般根据病变程度，可以选择做穿透性角膜移植术或者板层角膜移植术。
穿透性角膜移植术：
是以全层透明角膜代替全层混浊角膜的方法。
适应症按其手术目的可分为光学性、治疗性、成形性、美容性等方面。光学性角膜移植术常见的适应症为圆锥角膜、各种原因所致的角膜瘢痕、各种角膜营养不良、各种原因的所致的角膜内皮细胞功能衰竭。治疗性角膜移植术的主要适应症为化脓性角膜疡、眼化学伤、蚕蚀性角膜溃疡、角膜边缘变性等。
板层角膜移植术：
是一种部分厚度的角膜移植。
手术时切除角膜前面的病变组织，留下底层组织作为移植床。故凡角膜病变未侵犯角膜深层，而内皮生理功能健康或可复原者，均可行板层角膜移植术。临床常用于中浅层角膜斑留或角膜营养不良性混浊，进行性角膜炎或溃疡、角膜瘘、角膜肿瘤，以及一些条件差不能作穿透性角膜移植的眼球，为改良角膜条件先作板层移植。
厦门眼科中心开展了飞秒激光辅助的光学板层角膜移植术，与传统板层角膜移植手术相比，具有并发症少，光学增视效果好，操作简单的优点。
另外，还有一种人工角膜移植术，但由于角膜组织对人工合成材料的排异反应等问题尚未解决，远期效果不佳，常造成移植处的房水渗漏及移植片的脱落，故目前尚不可能广泛应用。
现阶段人工角膜仅适用于患各种严重角膜疾患后的双目失明，特别是严重的化学烧伤引起的全部角膜白斑和多次角膜移植术失败，无法再做其他手术者。
